RESUMO
ABSTRACT: Physalis rugose mosaic virus (PhyRMV) causes severe damage to Physalis peruviana L., affecting vegetative parameters, fruit quantity and quality. The aim of this study was to perform a molecular characterization of PhyRMV associated with P. peruviana from commercial fields in the municipality of Lages, Santa Catarina State, Southern Brazil, and to evaluate its transmission by seeds. Plants displaying mosaic, dwarfism, and leaf malformation symptoms were collected from P. peruviana. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and high-throughput sequencing (HTS). For the virus transmission assay, seeds from PhyRMV-infected plants were used, and viral infection in seedlings was verified using symptomatic and molecular diagnosis. PhyRMV RNA has 4162 nucleotides (nts) and a genomic organization similar to that of other sobemoviruses and shares 97% nt identity with the previously characterized PhyRMV Piracicaba isolate. Results indicated the unlikely transmission of PhyRMV by physalis seeds.
RESUMO: Physalis rugose mosaic virus (PhyRMV) causa danos severos em Physalis peruviana L., afetando características vegetativas, a quantidade e qualidade de frutos. Os objetivos desse estudo consistem na caracterização molecular do PhyRMV associado a P. peruviana coletada em campos de produção em Lages, Santa Catarina, Brasil; e avaliar a transmissão do vírus por sementes. Plantas apresentando sintomas de mosaico, deformação e nanismo foram coletadas de P. peruviana. Amostras foliares dessas plantas foram utilizadas para extração de RNA de fita dupla, síntese de biblioteca de cDNA e sequenciamento de alto rendimento. No experimento de transmissão, sementes obtidas de plantas infectadas por PhyRMV foram utilizadas, e a infecção viral nas plântulas foi avaliada por inspeção visual de sintomas e diagnóstico molecular. O RNA viral apresentou 4162 nucleotideos (nts), a organização genômica foi similar à de outros sobemovírus e apresentou 97% de identidade de nucleotídeos com o isolado de Piracicaba de PhyRMV previamente caracterizado. Os resultados obtidos sugerem que é improvável a transmissão de PhyRMV por sementes de physalis.
RESUMO
ABSTRACT: European apple canker (EC) is caused by Neonectria ditissima, a pathogen officially registered as a quarantine pest in 2012. Thirty-five isolates of N. ditissima of different geographical regions of southern Brazil from apple branches showing symptoms of EC were identified by the specific pair primers Ch1 and Ch2 and analyzed concerning the virulence on Gala apple cultivar and morphophysiological characteristics. The disease symptoms were characterized and the isolates compared based on average mycelium growth (AMG), mycelium growth index (MGI), colony color, conidia type, dimensions and growth on potato dextrose agar (PDA), malt agar (AM), and synthetic SNAY (SN) culture media. Nineteen isolates showed the greatest AMG on PDA, forming three growth groups of 35.56 (GI), 52.71 (GII), and 62.67mm (GIII). Seven isolates showed MGI greater than 4.0mm diameter on PDA compared with that on AM and SN. The highest conidia production was on SN, and the predominant colony color in all media was white to beige with central pigmentation of brown and borders colored in shades of beige. There were significant differences among the average dimensions of micro- and macroconidia on PDA, AM, and SN. The pathogenicity was confirmed for all isolates despite of different morphophysiological characteristics. There was no correlation among isolates morphophysiological variability, virulence, and geographical origin.
RESUMO: O cancro europeu (CE) da macieira é causado pelo fungo Neonectria ditissima e foi oficialmente registrado como praga quarentenária em 2012. Foram avaliados 35 isolados de N. ditissima provenientes de ramos de macieira com sintomas típicos de CE de diferentes regiões do sul do Brasil. Os isolados foram identificados pelos primers específicos Ch1 e Ch2 e analisados quanto as características morfofisiológicas e virulência na cultivar de macieira Gala. Os sintomas foram caracterizados e os isolados comparados com base no crescimento micelial médio (CMM), índice de crescimento micelial (ICM), coloração das colônias e tipos, dimensões e produção de conídios em meios de cultura batata-dextrose-ágar (BDA), malte-ágar (MA) e meio sintético SNAY (SS). Dezenove isolados tiveram os maiores CMM sobre BDA, formando três grupos de crescimento de 35.56 (GI), 52.71 (GII) e 62.67mm (GIII). Sete isolados tiveram ICM maior de 4mm de diâmetro sobre BDA quando comparados com os meios MA e SS. A maior produção de conídios ocorreu sobre o meio SS e a coloração predominante foi de branco-à-bege com pigmentação central marrom e bordas de colônia em tons de bege. Foram observadas diferenças significativas nas dimensões médias dos micro- e macroconídios sobre os meios de culturas BDA, MA e SS. Todos os isolados foram patogênicos na cultivar de macieira gala, independentemente das diferenças morfofisiológicas. Não foram observadas correlações entre a variabilidade morfofisiológicas, virulência e origem geográfica dos isolados.
